孔庙前设置的水池叫“泮池”，而南京夫子庙的泮池却是秦淮河流经庙前的一段河道。位于河对岸的“二龙戏珠”大照壁，始建于明万历年间。
千年秦淮，自古画舫如织。古人赞之：
锦瑟微澜棹影开，花灯明灭夜徘徊，
一池春水胭脂色，流到前朝梦里来。
南京夫子庙历史上经历多次毁、建，最后一次毁于年侵华日寇的炮火。幸免于战火的个别建筑，在文革中又遭受拆除。夫子庙建筑群中唯一保存完好的古建筑只剩下泮池石栏，建于明正德年间。
上世纪八十年代开始对南京夫子庙进行修缮与复建。原址复建有天下文枢坊、魁星阁、聚星亭、棂星门、大成门、大成殿和两庑，修缮的项目有大照壁等。
在夫子庙一大片新建筑中，其中不乏有一些艺术珍品，如大成殿的“三宝”：孔子青铜塑像、孔子巨幅画像和38幅孔子圣迹图，实为全国之最。大成殿供奉祭祀孔子，现大殿的样式是仿建清代同治年间的建筑，大成殿屋顶上也横卧着“二龙戏珠”的巨大雕刻。大成殿前肃立着孔子的青铜塑像，塑像建造于年。塑像高4.18米，重公斤，是国内孔庙中最高的孔子青铜塑像。
大成殿内悬挂一幅孔子巨幅画像，画像高6.5米，宽3.15米，也是国内最大的孔子画像。
孔子圣迹图由38幅壁画组成，每幅画高2.5米，宽1.3米。壁画材料采用鸡血冻、寿山石、青田石、玛瑙等名贵玉石，以浮雕镶嵌造型。孔子圣迹图共塑造个人物雕像，造型自然、栩栩如生，用一个个小故事展示了孔子的生平事迹。
孔子圣迹图孔子圣迹图孔子圣迹图之“尼山致祷”孔子出生于公元前年，之前母亲颜氏曾为未出生的孔子经常祈祷于尼丘山。传说孔子生来头顶中间低、四周高，形似尼丘山。孔子排行老二，名丘，字仲尼。
孔子圣迹图之尼山致祷孔子圣迹图之“跪受赤虹”孔子沐浴斋戒跪向北斗告之其完成著说，传说有一道赤虹从天而降，化作黄玉，黄玉上刻有文字，意思是孔子的大作是奉天意而成，孔子跪拜接受。
孔子圣迹图之跪受赤虹孔子圣迹图之“作歌丘陵”公元前年，67岁高龄的孔子回到鲁国，撰文《丘陵之歌》，抒发了周游列国的感受。
孔子圣迹图之作歌丘陵孔子圣迹图之“治任别归”孔子死后，弟子们将其埋葬在鲁国的泗河边，守坟三年。三年服满，弟子们在坟前拜别了孔子，相别而去。只有子贡在墓侧搭建个茅屋，继续守墓三年，方才离去。
孔子圣迹图之治任别归题小诗一首：南京夫子庙遗址截取秦淮作泮池，通达照壁化龙时。呼来画舫向明月，大殿珍藏浑不知。